寛政12年（1800年）に著された『江戸名所図絵』によると、日本武尊が東征の帰途阿佐谷の地で休息し、後に尊の武功を慕った村人が旧社地（お伊勢の森と称される現在の阿佐谷北5丁目一帯）に一社を設けたのが当宮の始まりといわれております。建久年間（1190〜1198年）には土豪横井兵部（一説には横川兵部）が伊勢神宮に参拝したおり、神の霊示を受け、宮川の霊石を持ち帰り神明宮に安置したと伝えられ、この霊石は今も御神体として御本殿の奥深く鎮っております。

現在の総桧造りの社殿、神楽殿、神門等は昭和天皇御即位60年の奉祝記念事業の一環として、昭和61年より３年の歳月と５億円の浄財を費やして整備したものです。 　境内地は約3000坪のうっそうとした森をなしており、シイ、カシ、クス、ケヤキ、イチョウ等の巨木も多く都内最大の伊勢神宮勧請の御社であります。一方ＪＲ阿佐ヶ谷駅から徒歩2分の交通至便の地にあるため、年間を通し数十万人の参拝者で賑わいます。

また近年は骨董市、植木市、さらに能や伝統芸能の奉納、或いは杉並区主催のジャズストリートの会場になるなど、地域のコミュニケーションの場として広く親しまれております。 　中でも豊年満作を祝い神に感謝するものとして例大祭に奉納される「阿佐ヶ谷囃子」は、江戸時代末期からの伝統を誇り、区の無形文化財に指定されております。 　なお、例大祭には氏子内14カ所の御幸所から各神輿が集結し、一斉に氏子巡幸する姿は誠に壮観であり杉並の風物詩のひとつとなっております。

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